RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD1-201ENST00000331462 KLKP1Q107X0 134 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 C7orf33Q8WU49 177 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 OXTP01178 125 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 H7BZZ5 65 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 SCXQ7RTU7 201 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD1-201ENST00000331462 Q8N377 158 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 FAM236CP0DP71 79 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 PRYO14603 147 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 SPRR1AP35321 89 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZRX8 168 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 MRAPQ8TCY5 172 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 TENM3Q9P273 2699 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GW54 56 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV4-1P06312 121 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 NREPQ16612 68 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXD1-201ENST00000331462 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 EPM2AB3EWF7 344 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 ERC2-IT1O76042 136 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 Q9BRP9 147 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 BPY2O14599 106 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 TNP2Q05952 138 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFC1O43677 76 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 RMI2Q96E14 147 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 SNURFQ9Y675 71 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXD1-201ENST00000331462 FAM168BA1KXE4 195 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 CASC10Q5T4H9 136 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 RPL37AP8A6NKH3 93 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf84H3BNL1 204 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 Q8N9L7 120 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 ANK2Q01484 3957 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PNM2 257 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 Q5XG85 94 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 F8WEM9 126 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 C5orf47Q569G3 176 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 OCR1Q9BZK8 76 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.46□□□□□ -0.09
HOXD1-201ENST00000331462 Q8NBF4 154 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM254Q8TBM7 123 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf137Q5JT78 98 aa14.45□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 SPRR4Q96PI1 79 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0U1RQV1 116 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXD1-201ENST00000331462 REG3GQ6UW15 175 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXD1-201ENST00000331462 C4orf26Q17RF5 130 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2BP63146 152 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXD1-201ENST00000331462 STAB1Q9NY15 2570 aa14.34□□□□□ -0.11
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM29Q86T20 159 aa14.33□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 LCE6AA0A183 80 aa14.31□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 DSCR10P59022 87 aa14.29□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM26A0A096LP01 95 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf90A8MZG2 172 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXD1-201ENST00000331462 K7EIL1 84 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 A0A096LNI7 61 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 COL6A5A8TX70 2615 aa14.23□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 NOTCH1P46531 2555 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.22□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 K7EQZ3 153 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 IGFL1Q6UW32 110 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 HIGD2AQ9BW72 106 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXD1-201ENST00000331462 FAM30AQ9NZY2 134 aa14.2□□□□□ -0.14
HOXD1-201ENST00000331462 MDFIQ99750 246 aa14.19□□□□□ -0.14
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PNN7 141 aa14.18□□□□□ -0.14
HOXD1-201ENST00000331462 PRLHP81277 87 aa14.16□□□□□ -0.14
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 HCG22E2RYF7 251 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 PSCAO43653 123 aa14.13□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 C14orf177Q52M58 125 aa14.12□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 H0Y9J4 135 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 SPRR1BP22528 89 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0G2JQZ4 141 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms