RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 LINC01600Q96MT4 127 aa12.23□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 A0A087WYN8 130 aa12.22□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 TRIAP1O43715 76 aa12.22□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.21□□□□□ -0.45
SYTL1-201ENST00000318074 C9JAW5 83 aa12.21□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.21□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 C7orf33Q8WU49 177 aa12.2□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 CDIP1Q9H305 208 aa12.19□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.19□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 PKHD1P08F94 4074 aa12.19□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.19□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV6-57P01721 117 aa12.19□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 Q6ZSA8 131 aa12.18□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00167Q96N53 147 aa12.18□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.17□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.17□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 COX6CP09669 75 aa12.16□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 EPM2AB3EWF7 344 aa12.15□□□□□ -0.46
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.14□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.14□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 SMIM11BQ8TCY0 68 aa12.14□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 UBE2BP63146 152 aa12.13□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.13□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 SCXQ7RTU7 201 aa12.13□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 LST1O00453 97 aa12.11□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.11□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 H3BT86 120 aa12.09□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 HAMPP81172 84 aa12.09□□□□□ -0.47
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 XGP55808 180 aa12.08□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 C6orf99Q4VX62 202 aa12.08□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 CLEC2BQ92478 149 aa12.07□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 PRYO14603 147 aa12.07□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 DIRC1Q969H9 104 aa12.07□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 MT-ATP8P03928 68 aa12.06□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 REG3GQ6UW15 175 aa12.05□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 LRP1BQ9NZR2 4599 aa12.04□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa12.04□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.03□□□□□ -0.48
SYTL1-201ENST00000318074 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12.01□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 SPRR1AP35321 89 aa12.01□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 DNAH8Q96JB1 4490 aa12□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 H0YGX0 51 aa11.99□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.99□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 A0A1B0GV72 72 aa11.98□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 COX7BP24311 80 aa11.98□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.98□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.96□□□□□ -0.49
SYTL1-201ENST00000318074 TRACP01848 142 aa11.96□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 B5MCH6 92 aa11.95□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 BCE1O60756 84 aa11.95□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 Q6ZRX8 168 aa11.95□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.94□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 C1orf137Q5JT78 98 aa11.94□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.93□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 SNCGO76070 127 aa11.92□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 UBE2AP49459 152 aa11.92□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.92□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 PRLHP81277 87 aa11.92□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 LINC00575Q6W349 94 aa11.92□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SYTL1-201ENST00000318074 CDK2AP2O75956 126 aa11.9□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 hADV29S1A0JD25 119 aa11.89□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 H0Y9J4 135 aa11.89□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa11.89□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.88□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 Q9BRP9 147 aa11.88□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 Q6Q795 121 aa11.87□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.87□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 A0A1B0GX51 115 aa11.86□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 DNAL4O96015 105 aa11.86□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 IGLV7-43P04211 117 aa11.85□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.85□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.84□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.84□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 ACYP1P07311 99 aa11.84□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF861PO60384 105 aa11.83□□□□□ -0.52
SYTL1-201ENST00000318074 ERC2-IT1O76042 136 aa11.8□□□□□ -0.52
SYTL1-201ENST00000318074 Q6ZQY7 126 aa11.8□□□□□ -0.52
SYTL1-201ENST00000318074 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SYTL1-201ENST00000318074 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.78□□□□□ -0.52
SYTL1-201ENST00000318074 FAM229AH3BQW9 127 aa11.77□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.76□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.76□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.76□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GHRHP01286 108 aa11.75□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.75□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 DEFB105AQ8NG35 78 aa11.75□□□□□ -0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms