RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

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Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00846Q9NV44 126 aa9.21□□□□□ -0.94
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PTPRVP-205ENST00000641549 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRVP-205ENST00000641549 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRVP-205ENST00000641549 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRVP-205ENST00000641549 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRVP-205ENST00000641549 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.17□□□□□ -0.94
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PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.07□□□□□ -0.96
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PTPRVP-205ENST00000641549 Q6ZRP5 223 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRVP-205ENST00000641549 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRVP-205ENST00000641549 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.97□□□□□ -0.97
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PTPRVP-205ENST00000641549 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRVP-205ENST00000641549 C15orf56Q8N910 161 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRVP-205ENST00000641549 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRVP-205ENST00000641549 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRVP-205ENST00000641549 SPINK1P00995 79 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRVP-205ENST00000641549 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.87□□□□□ -0.99
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PTPRVP-205ENST00000641549 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRVP-205ENST00000641549 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRVP-205ENST00000641549 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRVP-205ENST00000641549 PRO0628Q9UI54 55 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRVP-205ENST00000641549 PMAIP1Q13794 54 aa8.83□□□□□ -1
PTPRVP-205ENST00000641549 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.82□□□□□ -1
PTPRVP-205ENST00000641549 PSPHP1O15172 72 aa8.82□□□□□ -1
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