RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.38□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.38□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 UQCR11O14957 56 aa11.38□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 WISP2O76076 250 aa11.37□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.37□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.36□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.36□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 AMELXQ99217 191 aa11.36□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.35□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 LTBP2Q14767 1821 aa11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 A0A1B0GW54 56 aa11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 RTL8CO15255 209 aa11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 LINC00167Q96N53 147 aa11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NFIC-211ENST00000641145 C4orf26Q17RF5 130 aa11.33□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.33□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 C16orf95Q9H693 158 aa11.33□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 CDIP1Q9H305 208 aa11.32□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 JMJD1CQ15652 2540 aa11.31□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.31□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.31□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.3□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.3□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.3□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.29□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 IGLV6-57P01721 117 aa11.28□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 MIR22HGQ0VDD5 57 aa11.28□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 ZNF580Q9UK33 172 aa11.28□□□□□ -0.6
NFIC-211ENST00000641145 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.27□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 PCSK5Q92824 1860 aa11.26□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZQT0 140 aa11.26□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZSN1 163 aa11.25□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.25□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 BCE1O60756 84 aa11.24□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 LINC00483Q53H64 154 aa11.23□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.22□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11.22□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 COA5Q86WW8 74 aa11.22□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.21□□□□□ -0.61
NFIC-211ENST00000641145 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZRX8 168 aa11.2□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 ERC2-IT1O76042 136 aa11.2□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 AVPP01185 164 aa11.2□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.2□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 LINC00315P59091 139 aa11.19□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 A8MWP4 228 aa11.18□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZPA2 131 aa11.18□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 C9orf92A6NGG3 77 aa11.18□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 A0A0D9SG42 100 aa11.18□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.15□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.15□□□□□ -0.62
NFIC-211ENST00000641145 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.14□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 K7EQZ3 153 aa11.14□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 PRO3102Q9H379 93 aa11.14□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.13□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.12□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.12□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-9P60411 292 aa11.11□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 DSCR10P59022 87 aa11.09□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 CR1P17927 2039 aa11.09□□□□□ -0.63
NFIC-211ENST00000641145 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.08□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 ZNF575Q86XF7 245 aa11.08□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 H3BNG1 76 aa11.07□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.07□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 A8MUN3 132 aa11.06□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.06□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.05□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 COL4A3Q01955 1670 aa11.05□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.05□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa11.04□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 M0R2T5 61 aa11.04□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.03□□□□□ -0.64
NFIC-211ENST00000641145 CDSNQ15517 529 aa11.01□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.98□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 MTORP42345 2549 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 CD164Q04900 197 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 LCA10Q71F78 164 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 IGF2RP11717 2491 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 NCOR2Q9Y618 2525 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.97□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 FAM218AQ96MZ4 157 aa10.96□□□□□ -0.65
NFIC-211ENST00000641145 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.96□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.95□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 FAM168BA1KXE4 195 aa10.95□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 A0A1B0GVX0 72 aa10.94□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.91□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 FAM104AQ969W3 186 aa10.9□□□□□ -0.66
NFIC-211ENST00000641145 LINC00310P59036 64 aa10.89□□□□□ -0.67
NFIC-211ENST00000641145 Q1T7F1 81 aa10.88□□□□□ -0.67
NFIC-211ENST00000641145 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms