RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637904.1

ARID1B-232, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 5,913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-232ENST00000637904 PTPRSQ13332 1948 aa7.06□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.05□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 30.2
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ARID1B-232ENST00000637904 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.04□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.04□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 H7BZZ5 65 aa7.04□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.03□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.03□□□□□ -1.28
ARID1B-232ENST00000637904 PIEZO1Q92508 2521 aa7.03□□□□□ -1.28
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ARID1B-232ENST00000637904 ABCA1O95477 2261 aa7.02□□□□□ -1.29
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ARID1B-232ENST00000637904 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ARID1B-232ENST00000637904 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.02□□□□□ -1.29
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ARID1B-232ENST00000637904 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ARID1B-232ENST00000637904 C16orf95Q9H693 158 aa6.99□□□□□ -1.29
ARID1B-232ENST00000637904 RTL8CO15255 209 aa6.99□□□□□ -1.29
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ARID1B-232ENST00000637904 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.98□□□□□ -1.29
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ARID1B-232ENST00000637904 PTPN13Q12923 2485 aa6.97□□□□□ -1.29
ARID1B-232ENST00000637904 ZNF575Q86XF7 245 aa6.97□□□□□ -1.29
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ARID1B-232ENST00000637904 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 IGFL1Q6UW32 110 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 FHL3Q13643 280 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 DMAC1Q96GE9 116 aa6.95□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 EP400Q96L91 3159 aa6.94□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.94□□□□□ -1.3
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ARID1B-232ENST00000637904 MED13LQ71F56 2210 aa6.94□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 C9orf92A6NGG3 77 aa6.93□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 Q75L30 129 aa6.92□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 CACNA1AO00555 2505 aa6.92□□□□□ -1.3
ARID1B-232ENST00000637904 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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ARID1B-232ENST00000637904 A0A1B0GU33 70 aa6.85□□□□□ -1.31
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ARID1B-232ENST00000637904 A0A1W2PPR1 153 aa6.84□□□□□ -1.31
ARID1B-232ENST00000637904 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.83□□□□□ -1.32
ARID1B-232ENST00000637904 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.83□□□□□ -1.32
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ARID1B-232ENST00000637904 C15orf56Q8N910 161 aa6.82□□□□□ -1.32
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ARID1B-232ENST00000637904 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.81□□□□□ -1.32
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ARID1B-232ENST00000637904 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.79□□□□□ -1.32
ARID1B-232ENST00000637904 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.78□□□□□ -1.32
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ARID1B-232ENST00000637904 Q5XG85 94 aa6.78□□□□□ -1.32
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ARID1B-232ENST00000637904 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 A0A0G2JQZ4 141 aa6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 A0A1W2PNN7 141 aa6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 PLCE1Q9P212 2302 aa6.77□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.75□□□□□ -1.33
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ARID1B-232ENST00000637904 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.74□□□□□ -1.33
ARID1B-232ENST00000637904 ZNF861PO60384 105 aa6.74□□□□□ -1.33
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