RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635928.1

ARID1B-211, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-211ENST00000635928 LINC00310P59036 64 aa7.37□□□□□ -1.23
ARID1B-211ENST00000635928 LINC00167Q96N53 147 aa7.37□□□□□ -1.23
ARID1B-211ENST00000635928 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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ARID1B-211ENST00000635928 COLCA2A8K830 154 aa7.37□□□□□ -1.23
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ARID1B-211ENST00000635928 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.36□□□□□ -1.23
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ARID1B-211ENST00000635928 IGKV2D-28P01615 120 aa7.33□□□□□ -1.24
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ARID1B-211ENST00000635928 HIST1H2BCP62807 126 aa7.26□□□□□ -1.25
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ARID1B-211ENST00000635928 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ARID1B-211ENST00000635928 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.26□□□□□ -1.25
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ARID1B-211ENST00000635928 M0R378 163 aa7.25□□□□□ -1.25
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ARID1B-211ENST00000635928 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.25□□□□□ -1.25
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ARID1B-211ENST00000635928 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.23□□□□□ -1.25
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ARID1B-211ENST00000635928 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.2□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 NMUP48645 174 aa7.2□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.2□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.19□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.18□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 E9PLD3 99 aa7.18□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 TSPAN13O95857 204 aa7.18□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.18□□□□□ -1.26
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ARID1B-211ENST00000635928 LINC01545Q5VT33 79 aa7.17□□□□□ -1.26
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ARID1B-211ENST00000635928 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 A0A0J9YXY3 114 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 C3orf79P0CE67 100 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 NPC2P61916 151 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 PET117Q6UWS5 81 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.16□□□□□ -1.26
ARID1B-211ENST00000635928 SPRR1AP35321 89 aa7.15□□□□□ -1.27
ARID1B-211ENST00000635928 PRR4Q16378 134 aa7.15□□□□□ -1.27
ARID1B-211ENST00000635928 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
ARID1B-211ENST00000635928 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.14□□□□□ -1.27
ARID1B-211ENST00000635928 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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