RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 ERG28Q9UKR5 140 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 H3BRM9 83 aa10□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 AKAP14Q86UN6 197 aa10□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 COX17Q14061 63 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A20O43772 301 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 PMVKQ15126 192 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00483Q53H64 154 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 MOBPQ13875 183 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 LINC01549A6NIU2 74 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 PRYO14603 147 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 PCOTHQ58A44 107 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 IGLC3P0DOY3 106 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2C-208ENST00000617055 MT-ND4LP03901 98 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 SPRR1AP35321 89 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 LINC01546A6NGU7 62 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00158P58513 81 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 SFTA2Q6UW10 78 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 M0R2T5 61 aa9.86□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 NDUFA6P56556 154 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2C-208ENST00000617055 A0A0U1RRA0 63 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 NCR3O14931 201 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 ERC2-IT1O76042 136 aa9.82□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.81□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 FA2HQ7L5A8 372 aa9.8□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.79□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 B5MCH6 92 aa9.79□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.79□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 C9orf92A6NGG3 77 aa9.78□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.78□□□□□ -0.84
UBE2C-208ENST00000617055 C11orf86A6NJI1 115 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 ATP6V1G1O75348 118 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 S100A12P80511 92 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 SMIM13P0DJ93 91 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 Q9BRP9 147 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 A0A096LNJ9 63 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 Q6ZRX8 168 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2C-208ENST00000617055 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 BAGE3Q86Y29 109 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 SSPOA2VEC9 5147 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 LIMD2Q9BT23 127 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 DDTP30046 118 aa9.68□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM223A0PJW6 202 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 IGLV6-57P01721 117 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 HBDP02042 147 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 USH2AO75445 5202 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 PMCHL1Q16048 86 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00587B1AMM8 73 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 HERV-K104P63124 156 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.63□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 LINC00614P0C842 121 aa9.62□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.62□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 S100PP25815 95 aa9.61□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 COX19Q49B96 90 aa9.61□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.59□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.59□□□□□ -0.87
UBE2C-208ENST00000617055 C5orf52A6NGY3 159 aa9.58□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.58□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 SEC11CQ9BY50 192 aa9.58□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.57□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.57□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.57□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.54□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 SPRR1BP22528 89 aa9.54□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.54□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBE2C-208ENST00000617055 CD164Q04900 197 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms