RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596440.5

ZNF83-208, Transcript of zinc finger protein 83, human

TSL 4

Gene ZNF83, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF83-208	ENST00000596440	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ZNF83-208	ENST00000596440	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ZNF83-208	ENST00000596440	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ZNF83-208	ENST00000596440	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00614	P0C842	121 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00158	P58513	81 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	IFITM2	Q01629	132 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	COX19	Q49B96	90 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.27	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	HBD	P02042	147 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	DAND5	Q8N907	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	CTAG1A	P78358	180 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440		A6NJY4	79 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	NCR3	O14931	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	RHEB	Q15382	184 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440		Q8NBF4	154 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ZNF83-208	ENST00000596440	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	PRY	O14603	147 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	SPRR1A	P35321	89 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	SPINK1	P00995	79 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	APOC3	P02656	99 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440		B5MCH6	92 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440		H0Y8G0	127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	HERV-K104	P63124	156 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	MOBP	Q13875	183 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440		Q9BRP9	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	DDT	P30046	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440		Q8N377	158 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ZNF83-208	ENST00000596440	HSBP1	O75506	76 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	SNAPIN	O95295	136 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	S100A12	P80511	92 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	LEPROT	O15243	131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440		Q6ZRX8	168 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	SVBP	Q8N300	66 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440		J3QQQ9	107 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	SLC25A20	O43772	301 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	NPC2	P61916	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	SERF1A	O75920	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	TRGC2	P03986	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	FABP4	P15090	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ZNF83-208	ENST00000596440	LINC00310	P59036	64 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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