RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PCP2Q8IVA1 136 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 C14orf144Q96I85 54 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 CARD19Q96LW7 228 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N814 137 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 DLEU1O43261 78 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 WFDC2Q14508 124 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 PRO1933Q9H354 126 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0J9YXY3 114 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM238C9JI98 176 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00158P58513 81 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 ERG28Q9UKR5 140 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-209ENST00000590049 PANO1I0J062 215 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 PFN2P35080 140 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 COX17Q14061 63 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF151Q2KHN1 245 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0U1RRA0 63 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM17BO60830 172 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf25Q5T742 122 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 COPS9Q8WXC6 57 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM13P0DJ93 91 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 HIGD1BQ9P298 99 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 SLPIP03973 132 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZVH6 145 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H4GQ99525 98 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 GAGE2BQ13066 116 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 GAGE2EQ4V326 116 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-209ENST00000590049 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 SPANXCQ9NY87 97 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 IFITM1P13164 125 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 NPC2P61916 151 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 TAL2Q16559 108 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DAND5Q8N907 189 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01600Q96MT4 127 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DDTP30046 118 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 HSD52Q0P140 79 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 DPH3Q96FX2 82 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 Q6ZRP5 223 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LITAFQ99732 161 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.3□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NJY4 79 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 PTTG1IPP53801 180 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC01620Q4KN68 170 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.29□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 M0R143 59 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 CTAG1AP78358 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 CEND1Q8N111 149 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A096LNI7 61 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.27□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.26□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFC2O95298 119 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 CHTF8P0CG12 524 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP10-8P60410 259 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.24□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 A4D1N5 150 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 BATFQ16520 125 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB37Q96AX2 223 aa7.23□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 A6NDN8 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.22□□□□□ -1.25
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-209ENST00000590049 NCR3O14931 201 aa7.21□□□□□ -1.26
CAPNS1-209ENST00000590049 FXYD2P54710 66 aa7.21□□□□□ -1.26
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