RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0U1RRA0	63 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	XCL1	P47992	114 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL18	P55774	89 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	REG3A	Q06141	175 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	MTOR	P42345	2549 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0J9YWU9	116 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	PFN2	P35080	140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	XG	P55808	180 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8NAQ8	132 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SMR3A	Q99954	134 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	ITPR2	Q14571	2701 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	NF1	P21359	2839 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-ATP8	P03928	68 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE6G	P18545	87 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		3.06	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	JMJD1C	Q15652	2540 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.05	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A096LPF7	62 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8N814	137 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	NOTCH2	Q04721	2471 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	LECT2	O14960	151 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	HTN3	P15516	51 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.03	□□□□□ -1.92
PTPRM-215	ENST00000583289	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB4A	O15263	64 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	CCK	P06307	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	RMI2	Q96E14	147 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.02	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289		M0R378	163 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6JHZ5	121 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00575	Q6W349	94 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289		Q9HAA7	133 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GW54	56 aa		3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3	□□□□□ -1.93
PTPRM-215	ENST00000583289	ATOX1	O00244	68 aa		3	□□□□□ -1.93

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