RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	APOM	O95445	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	COX7A2L	O14548	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	HSD52	Q0P140	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	RMI2	Q96E14	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFA1	O15239	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	TIMM17B	O60830	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	COX6A2	Q02221	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139		Q6ZVH6	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139		Q8IZM0	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	XCL1	P47992	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139		M0QXV9	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	PSPHP1	O15172	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	CTAG1A	P78358	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNOT1-222	ENST00000570139	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	IFITM1	P13164	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	PSMB2	P49721	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	CKS1B	P61024	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	CD164	Q04900	197 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	COX17	Q14061	63 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	DSCR10	P59022	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	BATF	Q16520	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFS5	O43920	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0B4J2C4	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	PSCA	O43653	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	FXYD2	P54710	66 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00158	P58513	81 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	TG	P01266	2768 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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