RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631		A6NDN8	102 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	GAGE2B	Q13066	116 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	NDUFC2	O95298	119 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RNPS1-223	ENST00000568631	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1B0GWB2	263 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	CFC1B	P0CG36	223 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	CFC1	P0CG37	223 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	RYR3	Q15413	4870 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A0B4J2C4	111 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A096LNI7	61 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631		K7ERJ3	54 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	TAX1BP3	O14907	124 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	IGKV2D-28	P01615	120 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631		Q8NDZ9	215 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	VPREB1	P12018	145 aa		10.34	□□□□□ -0.75
RNPS1-223	ENST00000568631	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	RYR2	Q92736	4967 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	NCR3	O14931	201 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	CHTF8	P0CG12	524 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631		M0R378	163 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM126A	Q9H061	195 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RNPS1-223	ENST00000568631		H7C2G1	150 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1W2PNN7	141 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		Q1RN00	199 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	C22orf24	Q9Y442	160 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1B0GVY2	172 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	PANO1	I0J062	215 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	TSPAN13	O95857	204 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV6-57	P01721	117 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	C9orf118	A6NHY6	69 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		M0QXV9	152 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A087WYN8	130 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631		H3BUT2	72 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	KRTAP10-1	P60331	282 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNPS1-223	ENST00000568631	EPM2A	B3EWF7	344 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	PSMB2	P49721	201 aa		10.21	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	SVIP	Q8NHG7	77 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631		Q6ZSA8	131 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	TRIAP1	O43715	76 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	COX6C	P09669	75 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631		A0A1W2PPM0	123 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	FABP2	P12104	132 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	UBE2B	P63146	152 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	UBE2V1	Q13404	147 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	PRY	O14603	147 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RNPS1-223	ENST00000568631	PKD1	P98161	4303 aa		10.15	□□□□□ -0.79

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