RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 C16orf90A8MZG2 172 aa11.67□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.67□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 DAND5Q8N907 189 aa11.67□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 A6NJY4 79 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 NDUFC2O95298 119 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.66□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.65□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.65□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.65□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.65□□□□□ -0.54
MFGE8-210ENST00000559259 PCP4L1A6NKN8 68 aa11.64□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.64□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 ABCA13Q86UQ4 5058 aa11.63□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 HSPG2P98160 4391 aa11.62□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE2EQ4V326 116 aa11.62□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.62□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.61□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 A0A096LNI7 61 aa11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 A4D1N5 150 aa11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 FXYD2P54710 66 aa11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 KRTAP10-2P60368 255 aa11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 GAGE2BQ13066 116 aa11.6□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1B0GWB2 263 aa11.59□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 NPC2P61916 151 aa11.59□□□□□ -0.55
MFGE8-210ENST00000559259 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.58□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 A0A0B4J2C4 111 aa11.58□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.58□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 A6NDN8 102 aa11.57□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 VPREB1P12018 145 aa11.57□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 EPM2AB3EWF7 344 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.55□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 CFC1BP0CG36 223 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 CFC1P0CG37 223 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 LINC01620Q4KN68 170 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.54□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 IGKV2D-28P01615 120 aa11.53□□□□□ -0.56
MFGE8-210ENST00000559259 Q8NDZ9 215 aa11.52□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 M0R378 163 aa11.51□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 Q6ZSA8 131 aa11.51□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 CHTF8P0CG12 524 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.579e-9■□□□□ 9
MFGE8-210ENST00000559259 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 RAB37Q96AX2 223 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 BATFQ16520 125 aa11.49□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.49□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 TMEM126AQ9H061 195 aa11.49□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.48□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa11.48□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.48□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1W2PNN7 141 aa11.47□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 FAM168BA1KXE4 195 aa11.47□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 IGLV6-57P01721 117 aa11.47□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.47□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 C22orf24Q9Y442 160 aa11.47□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 PANO1I0J062 215 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 NCR3O14931 201 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 CDK2AP2O75956 126 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 KRTAP10-1P60331 282 aa11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
MFGE8-210ENST00000559259 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.45□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 A0A087WYN8 130 aa11.44□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 K7ERJ3 54 aa11.44□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 M0QXV9 152 aa11.44□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 C7orf33Q8WU49 177 aa11.43□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 DPH3Q96FX2 82 aa11.43□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.42□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 LINC00167Q96N53 147 aa11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.4□□□□□ -0.58
MFGE8-210ENST00000559259 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.39□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 PRYO14603 147 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 TAX1BP3O14907 124 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 TSPAN13O95857 204 aa11.38□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.37□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.36□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11.36□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.35□□□□□ -0.59
MFGE8-210ENST00000559259 C9orf118A6NHY6 69 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms