RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 FAM168BA1KXE4 195 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 TMEM238C9JI98 176 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 PTTG1IPP53801 180 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 COX17Q14061 63 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SPANXCQ9NY87 97 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 HIGD1BQ9P298 99 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 C16orf90A8MZG2 172 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 TSTD3H0UI37 97 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 GCSHP23434 173 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 LINC00587B1AMM8 73 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PNN7 141 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 HAMPP81172 84 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 Q6ZSA8 131 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 HIST1H4GQ99525 98 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-216ENST00000549221 VPREB1P12018 145 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 DDTP30046 118 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 FXYD2P54710 66 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 A0A087WYN8 130 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 IFITM1P13164 125 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 HSD52Q0P140 79 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 Q6ZVH6 145 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 CEND1Q8N111 149 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 A4D1N5 150 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 EPM2AB3EWF7 344 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 NCR3O14931 201 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 IGKV2D-28P01615 120 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 TAL2Q16559 108 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 SCXQ7RTU7 201 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 GAGE10A6NGK3 116 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 K7ERJ3 54 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 M0QXV9 152 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 NDUFC2O95298 119 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 C7orf33Q8WU49 177 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 C22orf24Q9Y442 160 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 CFC1BP0CG36 223 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 CFC1P0CG37 223 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 XGP55808 180 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 DPH3Q96FX2 82 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 HSPG2P98160 4391 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 LINC00167Q96N53 147 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CS-216ENST00000549221 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GWB2 263 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 M0R143 59 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 M0R378 163 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 BATFQ16520 125 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 COPS9Q8WXC6 57 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 A0A0B4J2C4 111 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 LCE2BO14633 110 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 IGLV6-57P01721 117 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 FAT1Q14517 4588 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-216ENST00000549221 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.05□□□□□ -1.6
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