RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 FABP9Q0Z7S8 132 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 LINC00158P58513 81 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 DAND5Q8N907 189 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 SFTA2Q6UW10 78 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 Q8NBF4 154 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 COX19Q49B96 90 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 A0A096LNJ9 63 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 A0A0U1RRA0 63 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 TMEM218A2RU14 115 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 C11orf86A6NJI1 115 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 BAGE3Q86Y29 109 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-214ENST00000548849 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 SPINK1P00995 79 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 HBDP02042 147 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 LINC00614P0C842 121 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 PMCHL1Q16048 86 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 CLLU1Q5K131 121 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 PRYO14603 147 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 ATP6V1G1O75348 118 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 UQCC3Q6UW78 93 aa9.56□□□□□ -0.88
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CS-214ENST00000548849 NCR3O14931 201 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 SEC11CQ9BY50 192 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 SMIM13P0DJ93 91 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 SPRR1AP35321 89 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-214ENST00000548849 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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CS-214ENST00000548849 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 TMEM223A0PJW6 202 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 LINC00483Q53H64 154 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 MOBPQ13875 183 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 S100A12P80511 92 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 Q8N377 158 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-214ENST00000548849 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.47□□□□□ -0.89
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CS-214ENST00000548849 LINC00587B1AMM8 73 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 B5MCH6 92 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 SLC25A20O43772 301 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 ERC2-IT1O76042 136 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 HERV-K104P63124 156 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 RHEBQ15382 184 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.44□□□□□ -0.9
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CS-214ENST00000548849 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 XP32Q5T750 250 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 DDTP30046 118 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 COMMD7Q86VX2 200 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 Q9BRP9 147 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-214ENST00000548849 IFITM2Q01629 132 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 Q6ZRX8 168 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.37□□□□□ -0.91
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CS-214ENST00000548849 LCE2CQ5TA81 110 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 H0Y8G0 127 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-214ENST00000548849 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 LEPROTO15243 131 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 HSBP1O75506 76 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 IGLV6-57P01721 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 NDUFC2O95298 119 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 APOC3P02656 99 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 PCOTHQ58A44 107 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 J3QQQ9 107 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 MT1HP80294 61 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-214ENST00000548849 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.28□□□□□ -0.92
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