RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.17□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q9BRP9 147 aa3.17□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A0C4DFX4 3053 aa3.17□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AVPP01185 164 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSHBP01222 138 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00313P59037 77 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ESRGQ1W209 222 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDSNQ15517 529 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV2-8P01709 118 aa3.16□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMKR1H3BMG3 65 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00208Q96KT6 92 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A8MWP4 228 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIAP1O43715 76 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZTC4 211 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LAMA3Q16787 3333 aa3.15□□□□□ -1.9
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM104AQ969W3 186 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FXYD2P54710 66 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MLANAQ16655 118 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1B0GU69 56 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRTAP10-9P60411 292 aa3.14□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A096LPF7 62 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP34Q70CQ2 3546 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UQCR11O14957 56 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H0Y9P7 68 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q8NAQ8 132 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OXTP01178 125 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A6NED7 52 aa3.13□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPRNQ5BIV9 151 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZSN1 163 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MSMPQ1L6U9 139 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.12□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q8N3U1 123 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ENHOQ6UWT2 76 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTL8CO15255 209 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00205P59089 165 aa3.11□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C15orf56Q8N910 161 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00483Q53H64 154 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLKP1Q107X0 134 aa3.1□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMR3AQ99954 134 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF861PO60384 105 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGLV6-57P01721 117 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FRYLO94915 3013 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC01600Q96MT4 127 aa3.09□□□□□ -1.91
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C22orf24Q9Y442 160 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPFP49454 3210 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRIP1P50238 77 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.08□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VCANP13611 3396 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 X6R8D5 127 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGKV2D-28P01615 120 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 Q6ZRU5 148 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRR15Q8IV56 129 aa3.07□□□□□ -1.92
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 J3QL48 77 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms