RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 LECT2O14960 151 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CKS1BP61024 79 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 CARD19Q96LW7 228 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-212ENST00000497037 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NCR3O14931 201 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZRP5 223 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 Q1RN00 199 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A087WYN8 130 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 ETDBQ3ZM63 59 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L23D6RBM5 183 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 LST1O00453 97 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 CXCL5P42830 114 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 COX17Q14061 63 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.14□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM168BA1KXE4 195 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 C9JAW5 83 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 F8W1H4 67 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 PCP4P48539 62 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC01620Q4KN68 170 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 VPREB1P12018 145 aa3.13□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC25A20O43772 301 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NDUFC2O95298 119 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 C2orf48Q96LS8 159 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC01600Q96MT4 127 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 IGLV6-57P01721 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 ATXN8Q156A1 80 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE2EQ4V326 116 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SYCNQ0VAF6 134 aa3.11□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 F8WDY8 70 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 PANO1I0J062 215 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 M0R2N4 97 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NUPR2A6NF83 97 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF151Q2KHN1 245 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 COPS9Q8WXC6 57 aa3.1□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TEN1Q86WV5 123 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 M0QXV9 152 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 C6orf99Q4VX62 202 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00167Q96N53 147 aa3.09□□□□□ -1.91
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A096LNI7 61 aa3.09□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.09□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 CDIP1Q9H305 208 aa3.09□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 PKHD1P08F94 4074 aa3.09□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM229AH3BQW9 127 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 CHTF8P0CG12 524 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 TRACP01848 142 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 Q6ZR54 194 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 C7orf33Q8WU49 177 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1W2PNN7 141 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 COX6CP09669 75 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM126AQ9H061 195 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 H3BT86 120 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00575Q6W349 94 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 Q8N814 137 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC7Q8TAX7 377 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1B0GV72 72 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-212ENST00000497037 GAGE2BQ13066 116 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.8 ms