RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494926.5

TM2D1-210, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene TM2D1, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-210ENST00000494926 H0Y8G0 127 aa6.75□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 M0R378 163 aa6.75□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 SVBPQ8N300 66 aa6.75□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.74□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.74□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.74□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 TMEM223A0PJW6 202 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 NCR3O14931 201 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 SMIM13P0DJ93 91 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 COX17Q14061 63 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 YPEL4Q96NS1 127 aa6.73□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.72□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.72□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.72□□□□□ -1.33
TM2D1-210ENST00000494926 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.71□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 ATP6V1G1O75348 118 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 HSBP1O75506 76 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 SFTA2Q6UW10 78 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.7□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.69□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.68□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 DAND5Q8N907 189 aa6.68□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.68□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 SERF1AO75920 110 aa6.67□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 TRGC2P03986 189 aa6.67□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.67□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 LINC00310P59036 64 aa6.66□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 SPRR4Q96PI1 79 aa6.66□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 MUC2Q02817 5179 aa6.65□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.65□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 PRYO14603 147 aa6.65□□□□□ -1.34
TM2D1-210ENST00000494926 LEPROTL1O95214 131 aa6.64□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 FABP4P15090 132 aa6.64□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 HERV-K104P63124 156 aa6.64□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.63□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.63□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.63□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.63□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 NPC2P61916 151 aa6.62□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 Q8NBF4 154 aa6.62□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 CDIP1Q9H305 208 aa6.62□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 MUC17Q685J3 4493 aa6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 LEPROTO15243 131 aa6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 SPRR1AP35321 89 aa6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 J3QQQ9 107 aa6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 DPM2O94777 84 aa6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.6□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 ERC2-IT1O76042 136 aa6.59□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 PLNP26678 52 aa6.59□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 DDTP30046 118 aa6.59□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 HERVK_113P61574 105 aa6.59□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.59□□□□□ -1.35
TM2D1-210ENST00000494926 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 LINC00587B1AMM8 73 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 B5MCH6 92 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 IGKCP01834 107 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 MOBPQ13875 183 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 TPRXLQ17RH7 258 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.58□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 A0A0U1RQV1 116 aa6.57□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.57□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 S100A12P80511 92 aa6.56□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 Q9BRP9 147 aa6.56□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 COLCA2A8K830 154 aa6.55□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.55□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.55□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 LINC00483Q53H64 154 aa6.54□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.54□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 Q6ZRX8 168 aa6.54□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.54□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.53□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 A0A0J9YXY3 114 aa6.53□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.53□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 NMUP48645 174 aa6.53□□□□□ -1.36
TM2D1-210ENST00000494926 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.52□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 IGLV6-57P01721 117 aa6.52□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.52□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.52□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.52□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 E9PLD3 99 aa6.51□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.5□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 NDUFC2O95298 119 aa6.5□□□□□ -1.37
TM2D1-210ENST00000494926 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.5□□□□□ -1.37
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