RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 APOC3P02656 99 aa9.48□□□□□ -0.89
RBM3-211ENST00000491240 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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RBM3-211ENST00000491240 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.47□□□□□ -0.89
RBM3-211ENST00000491240 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.47□□□□□ -0.89
RBM3-211ENST00000491240 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.46□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.44□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 TMEM223A0PJW6 202 aa9.43□□□□□ -0.9
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RBM3-211ENST00000491240 NCR3O14931 201 aa9.41□□□□□ -0.9
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RBM3-211ENST00000491240 ATP6V1G1O75348 118 aa9.4□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 SFTA2Q6UW10 78 aa9.4□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.4□□□□□ -0.9
RBM3-211ENST00000491240 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.39□□□□□ -0.91
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RBM3-211ENST00000491240 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.39□□□□□ -0.91
RBM3-211ENST00000491240 CDIP1Q9H305 208 aa9.39□□□□□ -0.91
RBM3-211ENST00000491240 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.38□□□□□ -0.91
RBM3-211ENST00000491240 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.37□□□□□ -0.91
RBM3-211ENST00000491240 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
RBM3-211ENST00000491240 SPRR4Q96PI1 79 aa9.37□□□□□ -0.91
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RBM3-211ENST00000491240 PRYO14603 147 aa9.34□□□□□ -0.91
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RBM3-211ENST00000491240 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.33□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 TPRXLQ17RH7 258 aa9.32□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.31□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 HERV-K104P63124 156 aa9.31□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 Q8NBF4 154 aa9.31□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.3□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.3□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 MUC17Q685J3 4493 aa9.3□□□□□ -0.92
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RBM3-211ENST00000491240 TRGC2P03986 189 aa9.29□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 SPRR1AP35321 89 aa9.29□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.29□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.29□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.29□□□□□ -0.92
RBM3-211ENST00000491240 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.29□□□□□ -0.92
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RBM3-211ENST00000491240 SERF1AO75920 110 aa9.27□□□□□ -0.93
RBM3-211ENST00000491240 ERC2-IT1O76042 136 aa9.27□□□□□ -0.93
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RBM3-211ENST00000491240 LINC00310P59036 64 aa9.27□□□□□ -0.93
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RBM3-211ENST00000491240 NPC2P61916 151 aa9.24□□□□□ -0.93
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RBM3-211ENST00000491240 MOBPQ13875 183 aa9.23□□□□□ -0.93
RBM3-211ENST00000491240 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RBM3-211ENST00000491240 S100A12P80511 92 aa9.22□□□□□ -0.93
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RBM3-211ENST00000491240 HERVK_113P61574 105 aa9.2□□□□□ -0.94
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RBM3-211ENST00000491240 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
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RBM3-211ENST00000491240 IGLV6-57P01721 117 aa9.15□□□□□ -0.94
RBM3-211ENST00000491240 NMUP48645 174 aa9.15□□□□□ -0.94
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RBM3-211ENST00000491240 A0A0J9YXY3 114 aa9.14□□□□□ -0.95
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