RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 PKHD1P08F94 4074 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 NPC2P61916 151 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 Q6Q795 121 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 F8WDY8 70 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 PFN2P35080 140 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 C15orf56Q8N910 161 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 C6orf223Q8N319 242 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 CARD19Q96LW7 228 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 M0R2N4 97 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 C2orf48Q96LS8 159 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 PKD1P98161 4303 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 CCDC179H3BU77 68 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 TEN1Q86WV5 123 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.4□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 TTC32Q5I0X7 151 aa8.4□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 C10orf25Q5T742 122 aa8.4□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.4□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 C5orf47Q569G3 176 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 TMEM126AQ9H061 195 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 M0QXV9 152 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.37□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 USP17L23D6RBM5 183 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 RTL8CO15255 209 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 HERC2O95714 4834 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 SYCNQ0VAF6 134 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 GAGE2BQ13066 116 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 Q1RN00 199 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 GAGE2EQ4V326 116 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 Q6ZRU5 148 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 NDUFC2O95298 119 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 Q6ZR54 194 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 H7C2G1 150 aa8.34□□□□□ -1.07
NELFE-209ENST00000488426 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 IGKV2D-28P01615 120 aa8.33□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GVY2 172 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 PSMB2P49721 201 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 LINC01600Q96MT4 127 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 PSCAO43653 123 aa8.32□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.31□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 SNCGO76070 127 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 TRIAP1O43715 76 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 COX6CP09669 75 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 C14orf177Q52M58 125 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 LECT2O14960 151 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 SLPIP03973 132 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-209ENST00000488426 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 TCL1BO95988 128 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 Q6ZRP5 223 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 Q8NDZ9 215 aa8.26□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GX51 115 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 TNP2Q05952 138 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 ATXN8Q156A1 80 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 NCR3O14931 201 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 RYR1P21817 5038 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
NELFE-209ENST00000488426 VPREB1P12018 145 aa8.22□□□□□ -1.09
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