RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.36□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf137Q5JT78 98 aa9.36□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf48Q96LS8 159 aa9.36□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF292O60281 2723 aa9.36□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.36□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZRU5 148 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 IMUPQ9GZP8 106 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 SEC61GP60059 68 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 REG3GQ6UW15 175 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 Q9UF83 564 aa9.35□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.34□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFC2O95298 119 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WYN8 130 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf25Q5T742 122 aa9.33□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 A8MTW9 85 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 SERP2Q8N6R1 65 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 COL6A5A8TX70 2615 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01546A6NGU7 62 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 ESRGQ1W209 222 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 FSHBP01225 129 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 FAM236CP0DP71 79 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 PRR4Q16378 134 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 X6R8D5 127 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 SNURFQ9Y675 71 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 F8WDY8 70 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-241ENST00000487169 Q6JHZ5 121 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 NOTCH1P46531 2555 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N9L7 120 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.27□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 PRLHP81277 87 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WSZ3 146 aa9.26□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 MDFIQ99750 246 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 Q9BRP9 147 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.25□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087WVE0 104 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00575Q6W349 94 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 PRYO14603 147 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 C22orf24Q9Y442 160 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 COX7CP15954 63 aa9.24□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFC1O43677 76 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 Q6Q795 121 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 BRK1Q8WUW1 75 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.21□□□□□ -0.93
HDLBP-241ENST00000487169 KLK9Q2XQG4 91 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N3U1 123 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 Q8NAQ8 132 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00208Q96KT6 92 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 H3BNG1 76 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.2□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.19□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.19□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.18□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.18□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.18□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.18□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00167Q96N53 147 aa9.17□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00846Q9NV44 126 aa9.17□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 LAMA5O15230 3695 aa9.16□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZVQ6 151 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF575Q86XF7 245 aa9.15□□□□□ -0.94
HDLBP-241ENST00000487169 ATMQ13315 3056 aa9.15□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.15□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 A0A096LNT2 108 aa9.14□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA0087Q14695 138 aa9.12□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 K7ERS5 55 aa9.1□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.09□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.09□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 V9GYY9 64 aa9.09□□□□□ -0.95
HDLBP-241ENST00000487169 TACC2O95359 2948 aa9.08□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 KALRNO60229 2985 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 PRR15LQ9BU68 103 aa9.07□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.06□□□□□ -0.96
HDLBP-241ENST00000487169 PCOTHQ58A44 107 aa9.06□□□□□ -0.96
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