RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 SFTA2Q6UW10 78 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 SPRR1AP35321 89 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 CTAG1AP78358 180 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 UBE2AP49459 152 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 PRLHP81277 87 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 TSPAN13O95857 204 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 PRR4Q16378 134 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 TRGC2P03986 189 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM13P0DJ93 91 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00158P58513 81 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 COLCA2A8K830 154 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 MUC17Q685J3 4493 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 HERV-K104P63124 156 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0U1RRA0 63 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 HSBP1O75506 76 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 SERF1AO75920 110 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 SPRR4Q96PI1 79 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 PRYO14603 147 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 LEPROTO15243 131 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 LEPROTL1O95214 131 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-232ENST00000470482 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00587B1AMM8 73 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00483Q53H64 154 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 TPRXLQ17RH7 258 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 J3QQQ9 107 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 PLNP26678 52 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 B5MCH6 92 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 NCR3O14931 201 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 ERC2-IT1O76042 136 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 DPM2O94777 84 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFC2O95298 119 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV6-57P01721 117 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 DAND5Q8N907 189 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 Q9BRP9 147 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 IGKCP01834 107 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 FABP4P15090 132 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 NMUP48645 174 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.66□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 H0Y8G0 127 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 ATP6V1G1O75348 118 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 LITAFQ99732 161 aa6.65□□□□□ -1.34
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0J9YXY3 114 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 E9PLD3 99 aa6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BKO60814 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BJP06899 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BOP23527 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 DDTP30046 118 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BBP33778 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BDP58876 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BCP62807 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZRX8 168 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 Q8NBF4 154 aa6.62□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01545Q5VT33 79 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.9 ms