RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAT4Q6V0I7 4981 aa14.93□□□□□ -0.02
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00310P59036 64 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 J3QQQ9 107 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPM2O94777 84 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINK1P00995 79 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HERVK_113P61574 105 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMUP48645 174 aa14.84□□□□□ -0.03
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FABP4P15090 132 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKCP01834 107 aa14.81□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOBPQ13875 183 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZRX8 168 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9BRP9 147 aa14.8□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFC2O95298 119 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV6-57P01721 117 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.77□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS29P62273 56 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPC2P61916 151 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0J9YXY3 114 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.7□□□□□ -0.06
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