RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC2BQ92478 149 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZANQ9Y493 2812 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 PIRTP0C851 137 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 CAV3P56539 151 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-5P60370 271 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.39□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.39□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA4P78363 2273 aa2.38□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.38□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf142B7Z368 130 aa2.38□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 H3BRN7 92 aa2.38□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 KLKP1Q107X0 134 aa2.38□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.38□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.38□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.38□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.37□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP5-9P26371 169 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO7BQ6PIF6 2116 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 BPESC1Q9GZL8 116 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.37□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP6Q13023 2319 aa2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WSZ3 146 aa2.36□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 BCE1O60756 84 aa2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 PRH1P02810 166 aa2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.36□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 HERC2O95714 4834 aa2.36□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.36□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM223BA6NKX1 122 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 COX6B1P14854 86 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE6HQ13956 83 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf82Q6UX34 121 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.35□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA1CQ13936 2221 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 ERC2-IT1O76042 136 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB133Q30KQ1 61 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.34□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SONP18583 2426 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
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CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GWA3 101 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 A6NIN4 97 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6JHZ5 121 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 C20orf197Q8N268 126 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF563Q8TA94 476 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM141Q96I45 108 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 GNG13Q9P2W3 67 aa2.33□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 HCG22E2RYF7 251 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 F8WEM9 126 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BVH4 76 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 LEPROTL1O95214 131 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2D1P51668 147 aa2.32□□□□□ -2.04
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM11AP58511 58 aa2.32□□□□□ -2.04
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