RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SMR3AQ99954 134 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 LRRK2Q5S007 2527 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 LITAFQ99732 161 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 ACACBO00763 2458 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 Q75L30 129 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM29Q86T20 159 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 IGKV2D-28P01615 120 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZRU5 148 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0087Q14695 138 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 SPRR4Q96PI1 79 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 C22orf24Q9Y442 160 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRD-201ENST00000355233 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 PTPN13Q12923 2485 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 EPM2AB3EWF7 344 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRD-201ENST00000355233 DMAC1Q96GE9 116 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 CRIPTQ9P021 101 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRD-201ENST00000355233 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRD-201ENST00000355233 OCR1Q9BZK8 76 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRD-201ENST00000355233 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A096LNT2 108 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRD-201ENST00000355233 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRD-201ENST00000355233 PCOTHQ58A44 107 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF861PO60384 105 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 SPRR1BP22528 89 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRD-201ENST00000355233 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.24□□□□□ -1.89
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