RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00694P0DN24 101 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 APOC4P55056 127 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 NPC2P61916 151 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE6Q13070 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 SS18Q15532 418 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7A2LO14548 114 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TRACP01848 142 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CRPP02741 224 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 PRO0255Q9UI72 69 aa4.87□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WZ39 114 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GUV1 79 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 SNCGO76070 127 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 ACYP1P07311 99 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 GYPEP15421 78 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CDIP1Q9H305 208 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 APLNQ9ULZ1 77 aa4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 H0YGX0 51 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB130BP0DP73 79 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB130AP0DP74 79 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00158P58513 81 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 DAND5Q8N907 189 aa4.85□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0U1RRA0 63 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf90A8MZG2 172 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB4AO15263 64 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK2AP2O75956 126 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL5P42830 114 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CKS1BP61024 79 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP161Q6P656 301 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N1X5 172 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC2BQ92478 149 aa4.84□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.84□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAL4O96015 105 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 MIFP14174 115 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 DAD1P61803 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE2BQ13066 116 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE2EQ4V326 116 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6Q795 121 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8IZM0 81 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.83□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.82□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.82□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ATP8P03928 68 aa4.82□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5G1P05496 136 aa4.82□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 X6R8D5 127 aa4.82□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 MALP21145 153 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 XGP55808 180 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 COX17Q14061 63 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC32Q5I0X7 151 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf38Q86SI9 138 aa4.81□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GX51 115 aa4.8□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.8□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.8□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.8□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 XCL1P47992 114 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL18P55774 89 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCBP2O75592 4640 aa4.79□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BQ85 93 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFC2O95298 119 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 PFN2P35080 140 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 LELP1Q5T871 98 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZTC4 211 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 IMUPQ9GZP8 106 aa4.78□□□□□ -1.64
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZR54 194 aa4.77□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.77□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.77□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 EPM2AB3EWF7 344 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 REG3AQ06141 175 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.76□□□□□ -1.65
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00643Q86TS7 51 aa4.76□□□□□ -1.65
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