RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 ITPR2Q14571 2701 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 TMEM258P61165 79 aa3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZRU5 148 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 Q8N814 137 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 ZANQ9Y493 2812 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 C10orf25Q5T742 122 aa3.85□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 J3KT08 172 aa3.84□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 C14orf177Q52M58 125 aa3.84□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 C16orf95Q9H693 158 aa3.84□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
LMO3-201ENST00000261169 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 M0QXV9 152 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 Q8N9L7 120 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC00846Q9NV44 126 aa3.84□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GUV1 79 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 COX17Q14061 63 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 H3BQ85 93 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 PRLHP81277 87 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 ESRGQ1W209 222 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.83□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 SERP2Q8N6R1 65 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 BRK1Q8WUW1 75 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FHL3Q13643 280 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 Q6Q795 121 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 CDIP1Q9H305 208 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 X6R8D5 127 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 C1orf137Q5JT78 98 aa3.82□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 MUC3AQ02505 3323 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM236CP0DP71 79 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 COX7CP15954 63 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC00575Q6W349 94 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 A0A0U1RQV1 116 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 HIVEP1P15822 2718 aa3.81□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WSZ3 146 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 IL17DQ8TAD2 202 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 NF1P21359 2839 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 PRO0461Q9UI25 63 aa3.8□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 IMUPQ9GZP8 106 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FSHBP01225 129 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC01546A6NGU7 62 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.79□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 Q6JHZ5 121 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZVQ6 151 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 LINC00208Q96KT6 92 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 REG3GQ6UW15 175 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 MUC7Q8TAX7 377 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 C7orf33Q8WU49 177 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 C22orf24Q9Y442 160 aa3.78□□□□□ -1.8
LMO3-201ENST00000261169 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.77□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 NDUFC2O95298 119 aa3.77□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 A0A096LNT2 108 aa3.77□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 Q8NAQ8 132 aa3.77□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 KIAA0087Q14695 138 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 FBN2P35556 2912 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 LINC00167Q96N53 147 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 Q9BRP9 147 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 CHTF8P0CG12 524 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 LITAFQ99732 161 aa3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 PCOTHQ58A44 107 aa3.75□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 CASC2Q6XLA1 102 aa3.75□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.75□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.75□□□□□ -1.81
LMO3-201ENST00000261169 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms