RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0U1RRA0 63 aa12.54□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.54□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 DAND5Q8N907 189 aa12.52□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.52□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GWB2 263 aa12.52□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 PFN2P35080 140 aa12.52□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.52□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 A4D1N5 150 aa12.51□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.5□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 NPC2P61916 151 aa12.5□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.49□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.48□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.48□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 TAX1BP3O14907 124 aa12.48□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 CDK2AP2O75956 126 aa12.48□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 PKIGQ9Y2B9 76 aa12.48□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.47□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0B4J2C4 111 aa12.47□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 K7ERJ3 54 aa12.47□□□□□ -0.41
HOXD11-201ENST00000249504 CFC1BP0CG36 223 aa12.46□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 CFC1P0CG37 223 aa12.46□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZRP5 223 aa12.46□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZSA8 131 aa12.46□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 RAB37Q96AX2 223 aa12.46□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.45□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 APOBP04114 4563 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf118A6NHY6 69 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH8Q96JB1 4490 aa12.43□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 A0A096LNI7 61 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 XGP55808 180 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 HAMPP81172 84 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE2BQ13066 116 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GV90 55 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.42□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE2EQ4V326 116 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.41□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 CHTF8P0CG12 524 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 DPH3Q96FX2 82 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA1109Q2LD37 5005 aa12.4□□□□□ -0.42
HOXD11-201ENST00000249504 SCXQ7RTU7 201 aa12.38□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 H3BUT2 72 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 PANO1I0J062 215 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00474Q9P2X8 69 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 SPACA4Q8TDM5 124 aa12.37□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 RYR1P21817 5038 aa12.36□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.36□□□□□ -0.43
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HOXD11-201ENST00000249504 NDUFC2O95298 119 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 TSPAN13O95857 204 aa12.35□□□□□ -0.43
HOXD11-201ENST00000249504 HSPG2P98160 4391 aa12.34□□□□□ -0.43
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HOXD11-201ENST00000249504 A0A087WYN8 130 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FABP2P12104 132 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 Q1RN00 199 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 VAMP3Q15836 100 aa12.32□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 H7C2G1 150 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.31□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 FAM168BA1KXE4 195 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 IGKV2D-28P01615 120 aa12.3□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PNN7 141 aa12.29□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PSMB2P49721 201 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.28□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 EPM2AB3EWF7 344 aa12.27□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.27□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00337Q8N6G1 96 aa12.27□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 Q8NDZ9 215 aa12.27□□□□□ -0.44
HOXD11-201ENST00000249504 Q8N1X5 172 aa12.27□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 HERC2O95714 4834 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 VPREB1P12018 145 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa12.26□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.25□□□□□ -0.45
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HOXD11-201ENST00000249504 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 OR13C6PQ8NH95 151 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SPCS1Q9Y6A9 102 aa12.25□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 GAGE10A6NGK3 116 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.24□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 FAM229AH3BQW9 127 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 K7EP34 96 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM126AQ9H061 195 aa12.23□□□□□ -0.45
HOXD11-201ENST00000249504 NCR3O14931 201 aa12.21□□□□□ -0.45
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