RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 CD164Q04900 197 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 Q8NBF4 154 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 LY6G6DO95868 133 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WYN8 130 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 UQCR11O14957 56 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 LINC01006Q8NI28 216 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.54□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 AGRNO00468 2067 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 Q8NA96 180 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00846Q9NV44 126 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 NOTCH2Q04721 2471 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.53□□□□□ -1.68
SCN2A-209ENST00000636071 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.53□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 FHL2Q14192 279 aa4.53□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.52□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.52□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf223Q8N319 242 aa4.52□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 CRIPTQ9P021 101 aa4.52□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PTPRSQ13332 1948 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 MSMPQ1L6U9 139 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PRR9Q5T870 116 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 CDIP1Q9H305 208 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 A0A087WVE0 104 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 LTBP2Q14767 1821 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.51□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB1P60022 68 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 FHL3Q13643 280 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PCOTHQ58A44 107 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 TECTAO75443 2155 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.5□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 X6R8D5 127 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTS20P59510 1910 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00310P59036 64 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 KLKP1Q107X0 134 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZRX8 168 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZPA2 131 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZQT0 140 aa4.49□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PTPN13Q12923 2485 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PLA2G5P39877 138 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 SMIM29Q86T20 159 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 NOTCH4Q99466 2003 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 A8MWP4 228 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZRP5 223 aa4.48□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PROK1P58294 105 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00313P59037 77 aa4.47□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.46□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.46□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 LY6G6CO95867 125 aa4.46□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV2-30P06310 120 aa4.46□□□□□ -1.69
SCN2A-209ENST00000636071 C22orf24Q9Y442 160 aa4.46□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 LCA10Q71F78 164 aa4.46□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 SPINK1P00995 79 aa4.46□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.46□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 PRR15Q8IV56 129 aa4.46□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 A0A096LNJ9 63 aa4.45□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 PRLHP81277 87 aa4.45□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 COX6A2Q02221 97 aa4.45□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 C16orf90A8MZG2 172 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 INAFM1C9JVW0 142 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 PIEZO1Q92508 2521 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 F8P00451 2351 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 COL4A3Q01955 1670 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 PRO0461Q9UI25 63 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0087Q14695 138 aa4.44□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.43□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 TTC28Q96AY4 2481 aa4.43□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 EPM2AB3EWF7 344 aa4.43□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 LINC01600Q96MT4 127 aa4.43□□□□□ -1.7
SCN2A-209ENST00000636071 KLK9Q2XQG4 91 aa4.43□□□□□ -1.7
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