RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617199.1

MFGE8-217, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

Gene MFGE8, Length 2,464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-217ENST00000617199 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 C2orf82Q6UX34 121 aa8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 H3BT86 120 aa8.84□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 COX7A2LO14548 114 aa8.84□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.84□□□□□ -0.99
MFGE8-217ENST00000617199 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CRPP02741 224 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 Q8IZM0 81 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 PFN2P35080 140 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 Q8N3U1 123 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CDIP1Q9H305 208 aa8.83□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.82□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CCL18P55774 89 aa8.82□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 REG3AQ06141 175 aa8.82□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.82□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.81□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 UBE2WQ96B02 151 aa8.81□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.81□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 IGKV2D-28P01615 120 aa8.81□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.8□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.8□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 LELP1Q5T871 98 aa8.8□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 SCGB1A1P11684 91 aa8.8□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP10-11P60412 298 aa8.79□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 CKS1BP61024 79 aa8.79□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.79□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 MALP21145 153 aa8.78□□□□□ -1
MFGE8-217ENST00000617199 KIAA0087Q14695 138 aa8.77□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 RETNQ9HD89 108 aa8.77□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 TRACP01848 142 aa8.77□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 CXCL5P42830 114 aa8.77□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 XGP55808 180 aa8.76□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 C3orf56Q8N813 242 aa8.76□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.75□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.75□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.75□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.75□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 STAB1Q9NY15 2570 aa8.75□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 MT-ATP8P03928 68 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 KLK12Q9UKR0 248 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 COX17Q14061 63 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 PRR34Q9NV39 138 aa8.74□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.73□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.72□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 H3BNG1 76 aa8.72□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.71□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 SPAG11BQ08648 103 aa8.71□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 Q6ZTC4 211 aa8.71□□□□□ -1.01
MFGE8-217ENST00000617199 H0YGX0 51 aa8.71□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 ENHOQ6UWT2 76 aa8.71□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.71□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 MAST4O15021 2626 aa8.7□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 Q9HAA7 133 aa8.69□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 A0A087WYN8 130 aa8.69□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 NDUFC2O95298 119 aa8.69□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 DNAL4O96015 105 aa8.69□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 C6orf223Q8N319 242 aa8.69□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.68□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.68□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 C10orf25Q5T742 122 aa8.68□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.68□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 TENM3Q9P273 2699 aa8.67□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.67□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.67□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 A0A0J9YWU9 116 aa8.66□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.66□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 C22orf24Q9Y442 160 aa8.66□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 SNCGO76070 127 aa8.65□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 MUC7Q8TAX7 377 aa8.65□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 ANK2Q01484 3957 aa8.65□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 LECT2O14960 151 aa8.65□□□□□ -1.02
MFGE8-217ENST00000617199 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 TMEM126AQ9H061 195 aa8.64□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 NCR3O14931 201 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 ESRGQ1W209 222 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 Q8NDZ9 215 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.63□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.62□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 ACYP1P07311 99 aa8.62□□□□□ -1.03
MFGE8-217ENST00000617199 NOTCH1P46531 2555 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.3 ms