RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CFC1BP0CG36 223 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 CFC1P0CG37 223 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 APLNQ9ULZ1 77 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 P0DMU3 169 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM231AP0DMU4 169 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM231CP0DMU5 169 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 BRK1Q8WUW1 75 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TCL1BO95988 128 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf74Q96GX8 76 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YXV3 536 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM223A0PJW6 202 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.73□□□□□ -1.01
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RABGEF1-209ENST00000607882 A0A096LPF7 62 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 I3L3M4 83 aa8.73□□□□□ -1.01
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 H7C2G1 150 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.72□□□□□ -1.01
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RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5G1P05496 136 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TEN1Q86WV5 123 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MWV9 139 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6Q795 121 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-33P01772 117 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 Q1RN00 199 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YXY3 114 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM104AQ969W3 186 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PKHD1P08F94 4074 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A20O43772 301 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0B4J2C4 111 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R2P5 195 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS2P07478 247 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGEF1-209ENST00000607882 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.65□□□□□ -1.02
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RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZSN1 163 aa8.65□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.64□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 NPC2P61916 151 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 hADV29S1A0JD25 119 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 VPREB1P12018 145 aa8.62□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.61□□□□□ -1.03
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RABGEF1-209ENST00000607882 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN8Q156A1 80 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGEF1-209ENST00000607882 DAND5Q8N907 189 aa8.59□□□□□ -1.03
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