RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZRP5 223 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.12□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CXCL5P42830 114 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDZD11Q5EBL8 140 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.11□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HERC1Q15751 4861 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP5LO75964 103 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CKS1BP61024 79 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A1W2PNN7 141 aa10.09□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OXTP01178 125 aa10.09□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLC3P0DOY3 106 aa10.09□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PMCHL1Q16048 86 aa10.09□□□□□ -0.79
TTC28-AS1-221ENST00000540665 F8VRH5 84 aa10.08□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H3BRM9 83 aa10.07□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 J3QL48 77 aa10.07□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE2EQ4V326 116 aa10.05□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COX7B2Q8TF08 81 aa10.05□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.05□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRGC2P03986 189 aa10.04□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPINK8P0C7L1 97 aa10.04□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NDUFA6P56556 154 aa10.04□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM168BA1KXE4 195 aa10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COLCA2A8K830 154 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSBP1O75506 76 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ODF1Q14990 250 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BAGE3Q86Y29 109 aa10.01□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPINK6Q6UWN8 80 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFI27L1Q96BM0 104 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C11orf86A6NJI1 115 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 M0QXV9 152 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00310P59036 64 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFTA2Q6UW10 78 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERF1AO75920 110 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LEPROTL1O95214 131 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf137Q5JT78 98 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REG3GQ6UW15 175 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM223A0PJW6 202 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MT1HL1P0DM35 61 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBE2BP63146 152 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COX17Q14061 63 aa9.92□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV7-43P04211 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC01600Q96MT4 127 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERG28Q9UKR5 140 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C22orf24Q9Y442 160 aa9.91□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUPR1O60356 82 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCO1O75880 301 aa9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PFN2P35080 140 aa9.88□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLNP26678 52 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNXBP22105 4242 aa9.87□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H0Y8G0 127 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BKO60814 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BJP06899 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BOP23527 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BBP33778 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BDP58876 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BCP62807 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIRC1Q969H9 104 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.86□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FABP4P15090 132 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.85□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 H0Y9J4 135 aa9.84□□□□□ -0.83
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HERV-K104P63124 156 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC00167Q96N53 147 aa9.83□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DPM2O94777 84 aa9.82□□□□□ -0.84
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms