RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGIPA6NJ69 53 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRSS2P07478 247 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UBE2D1P51668 147 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HERVK_113P63121 156 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GAGE2BQ13066 116 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIAA1644Q3SXP7 199 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C10orf25Q5T742 122 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ERASQ7Z444 233 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SVBPQ8N300 66 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM104AQ969W3 186 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AMELXQ99217 191 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.25□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SNAPINO95295 136 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 APOC3P02656 99 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FA2HQ7L5A8 372 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TOMM6Q96B49 74 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC01546A6NGU7 62 aa3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CKS1BP61024 79 aa3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q6ZRP5 223 aa3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.23□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A0J9YXV3 536 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CXCL5P42830 114 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RAB5BP61020 215 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIAA0087Q14695 138 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PMVKQ15126 192 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q8IZM0 81 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.22□□□□□ -1.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A1W2PNN7 141 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 F8VRH5 84 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 H3BRM9 83 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HBDP02042 147 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00614P0C842 121 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 REG3GQ6UW15 175 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CST9LQ9H4G1 147 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.21□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATP5LO75964 103 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GAGE2EQ4V326 116 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C2orf82Q6UX34 121 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.2□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 M0QXV9 152 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV2-30P06310 120 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLC3P0DOY3 106 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NDUFA6P56556 154 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UBE2BP63146 152 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SFTA2Q6UW10 78 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COX7B2Q8TF08 81 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM168BA1KXE4 195 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C1orf137Q5JT78 98 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DIRC1Q969H9 104 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC01600Q96MT4 127 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 YPEL4Q96NS1 127 aa3.18□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A096LNJ9 63 aa3.17□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSBP1O75506 76 aa3.17□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV7-43P04211 117 aa3.17□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPINK8P0C7L1 97 aa3.17□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BAGE3Q86Y29 109 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms