RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV7-43P04211 117 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q8IZM0 81 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2BP63146 152 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COMMD7Q86VX2 200 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIRC1Q969H9 104 aa14.24□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COX19Q49B96 90 aa14.23□□□□□ -0.13
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.21□□□□□ -0.13
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FA2HQ7L5A8 372 aa14.2□□□□□ -0.14
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.2□□□□□ -0.14
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.18□□□□□ -0.14
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CST9LQ9H4G1 147 aa14.17□□□□□ -0.14
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXCL5P42830 114 aa14.16□□□□□ -0.14
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.15□□□□□ -0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PMVKQ15126 192 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COX7B2Q8TF08 81 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C22orf24Q9Y442 160 aa14.14□□□□□ -0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR26Q8N8Z3 221 aa14.13□□□□□ -0.15
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPINK8P0C7L1 97 aa14.11□□□□□ -0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.09□□□□□ -0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H3BRM9 83 aa14.08□□□□□ -0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFA6P56556 154 aa14.08□□□□□ -0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUPR1O60356 82 aa14.06□□□□□ -0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.05□□□□□ -0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.04□□□□□ -0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF861PO60384 105 aa14.04□□□□□ -0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOC3P02656 99 aa14.04□□□□□ -0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP2P98164 4655 aa14.04□□□□□ -0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.97□□□□□ -0.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.93□□□□□ -0.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf86A6NJI1 115 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERG28Q9UKR5 140 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.88□□□□□ -0.19
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2AP49459 152 aa13.87□□□□□ -0.19
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV2D-28P01615 120 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFTA2Q6UW10 78 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YPEL4Q96NS1 127 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF213Q63HN8 5207 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPREB1P12018 145 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYGAP11844 174 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087X002 238 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR4Q16378 134 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00158P58513 81 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM223A0PJW6 202 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPAN13O95857 204 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0U1RRA0 63 aa13.77□□□□□ -0.21
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