RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.89□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 HILS1P60008 231 aa8.89□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF575Q86XF7 245 aa8.89□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.89□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.89□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 PRR4Q16378 134 aa8.88□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.88□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF702PQ9H963 129 aa8.88□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 SPAG11BQ08648 103 aa8.88□□□□□ -0.99
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TRIOBP-211ENST00000492485 APCP25054 2843 aa8.87□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.87□□□□□ -0.99
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TRIOBP-211ENST00000492485 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.87□□□□□ -0.99
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TRIOBP-211ENST00000492485 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.87□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 USP17L23D6RBM5 183 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.86□□□□□ -0.99
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TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM89A2RUT3 159 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 H0YGX0 51 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N3U1 123 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.86□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 UPK3BQ9BT76 320 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf84H3BNL1 204 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6ZQY7 126 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 C16orf74Q96GX8 76 aa8.85□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 UQCRQO14949 82 aa8.84□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 J3KT08 172 aa8.84□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00846Q9NV44 126 aa8.84□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.84□□□□□ -0.99
TRIOBP-211ENST00000492485 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 Q6YL49 198 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 AMELXQ99217 191 aa8.83□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 J3QLI3 93 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV2D-28P01615 120 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 REG3AQ06141 175 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 C6orf223Q8N319 242 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.82□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.81□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.81□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.8□□□□□ -1
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TRIOBP-211ENST00000492485 Q8N9L7 120 aa8.79□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.79□□□□□ -1
TRIOBP-211ENST00000492485 BRK1Q8WUW1 75 aa8.78□□□□□ -1
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TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.77□□□□□ -1.01
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TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01546A6NGU7 62 aa8.76□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.75□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 PSCAO43653 123 aa8.75□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.75□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.74□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 CR1P17927 2039 aa8.74□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 LITAFQ99732 161 aa8.74□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.73□□□□□ -1.01
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TRIOBP-211ENST00000492485 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf47Q569G3 176 aa8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 DIRC1Q969H9 104 aa8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF843Q8N446 348 aa8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.73□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 SERP2Q8N6R1 65 aa8.72□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.72□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A0J9YWU9 116 aa8.72□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 CCKP06307 115 aa8.72□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.72□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 J3QKU1 62 aa8.71□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.71□□□□□ -1.01
TRIOBP-211ENST00000492485 RETNQ9HD89 108 aa8.71□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.7□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.7□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 TIMM17BO60830 172 aa8.7□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 INAFM1C9JVW0 142 aa8.7□□□□□ -1.02
TRIOBP-211ENST00000492485 F8WEM9 126 aa8.69□□□□□ -1.02
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