RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 LY6G6CO95867 125 aa8.63□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 NUPR2A6NF83 97 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 XCL1P47992 114 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CEND1Q8N111 149 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 TM2D2Q9BX73 214 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 KLK12Q9UKR0 248 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 A0A0J9YXY3 114 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 GCSHP23434 173 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 HERV-K104P63124 156 aa8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 IGLL5B9A064 214 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 IGHV3-30P01768 117 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 IGHV3-33P01772 117 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 C5orf38Q86SI9 138 aa8.61□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CRPP02741 224 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CDIP1Q9H305 208 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 TIMM17BO60830 172 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 SMIM13P0DJ93 91 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 CCL18P55774 89 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 WFDC2Q14508 124 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 ENHOQ6UWT2 76 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 COX7B2Q8TF08 81 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 PRO0461Q9UI25 63 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 COX7A2LO14548 114 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 FXYD2P54710 66 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 RAB37Q96AX2 223 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 Q9H8V8 135 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-209ENST00000488426 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 MIAQ16674 131 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 SFTA2Q6UW10 78 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 FOXI1Q12951 378 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 UBE2WQ96B02 151 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 LITAFQ99732 161 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 UPK3BQ9BT76 320 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 SPANXCQ9NY87 97 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.57□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 Q8IZM0 81 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 APLNQ9ULZ1 77 aa8.56□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 MALP21145 153 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 ETDBQ3ZM63 59 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 DNAH2Q9P225 4427 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 PRSS2P07478 247 aa8.55□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 APOMO95445 188 aa8.54□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 MT-ATP8P03928 68 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 A0A1B0GWB2 263 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 CXCL5P42830 114 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.53□□□□□ -1.04
NELFE-209ENST00000488426 IFITM1P13164 125 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 XGP55808 180 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.52□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 KIAA0087Q14695 138 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 B5MCH6 92 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 COPS9Q8WXC6 57 aa8.51□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 H3BMG7 143 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.5□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 K7ERJ3 54 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 A4D1N5 150 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 SPAG11BQ08648 103 aa8.49□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 RMI2Q96E14 147 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 A0A0B4J2C4 111 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 CFC1BP0CG36 223 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 CFC1P0CG37 223 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 C2orf82Q6UX34 121 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 DAND5Q8N907 189 aa8.47□□□□□ -1.05
NELFE-209ENST00000488426 A0A0U1RRA0 63 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 LINC00158P58513 81 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 Q9HAA7 133 aa8.46□□□□□ -1.06
NELFE-209ENST00000488426 COX17Q14061 63 aa8.45□□□□□ -1.06
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