RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 AKAP13Q12802 2813 aa9.62□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 FRYQ5TBA9 3013 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.61□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 MT-ATP8P03928 68 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 CCKP06307 115 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 Q8IZM0 81 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 SVIPQ8NHG7 77 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 M0R378 163 aa9.6□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 C7orf33Q8WU49 177 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00694P0DN24 101 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 SCXQ7RTU7 201 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 ITPR3Q14573 2671 aa9.59□□□□□ -0.87
HDLBP-241ENST00000487169 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 FHL2Q14192 279 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.58□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 UPK3BQ9BT76 320 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.57□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 C5orf47Q569G3 176 aa9.56□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 C3orf84H3BNL1 204 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 LST1O00453 97 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 PTPRBP23467 1997 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV4-1P06312 121 aa9.55□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 COX17Q14061 63 aa9.54□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 STAB1Q9NY15 2570 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZSN1 163 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 C20orf197Q8N268 126 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 MUC3AQ02505 3323 aa9.53□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 XGP55808 180 aa9.52□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.52□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 MUC7Q8TAX7 377 aa9.52□□□□□ -0.88
HDLBP-241ENST00000487169 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 ENHOQ6UWT2 76 aa9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 COX6A2Q02221 97 aa9.51□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 DMDP11532 3685 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 NUPR2A6NF83 97 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 MGAQ8IWI9 3026 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 AMELXQ99217 191 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 C6orf223Q8N319 242 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N2B8 174 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 USP17L23D6RBM5 183 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GUV1 79 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 M0QXV9 152 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 CDIP1Q9H305 208 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 PRO0461Q9UI25 63 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 UQCRQO14949 82 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 FHL3Q13643 280 aa9.41□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 J3KT08 172 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 CASC2Q6XLA1 102 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-241ENST00000487169 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 CELA1Q9UNI1 258 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00315P59091 139 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 CHD6Q8TD26 2715 aa9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N814 137 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC179H3BU77 68 aa9.37□□□□□ -0.91
HDLBP-241ENST00000487169 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.36□□□□□ -0.91
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