RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZN92 141 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8IZM0 81 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 AMELXQ99217 191 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.53□□□□□ -1.52
SMARCE1-210ENST00000481231 BCE1O60756 84 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 PEA15Q15121 130 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 VCX2Q9H322 139 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 IGIPA6NJ69 53 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS47A8MTI9 375 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 F8VRH5 84 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYGAP11844 174 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N8P6 123 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 CDIP1Q9H305 208 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 NPSP0C0P6 89 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE10A6NGK3 116 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 HERVK_113P63121 156 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00167Q96N53 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 CXCL5P42830 114 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC11AP67812 179 aa5.47□□□□□ -1.53
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EMI3 77 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 TPRXLQ17RH7 258 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM17AQ99595 171 aa5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2AP49459 152 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 COX7B2Q8TF08 81 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 TOMM6Q96B49 74 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.45□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 SCO1O75880 301 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.44□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GVG6 124 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2D-28P01615 120 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 MT-ND4LP03901 98 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINK8P0C7L1 97 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 ADCYAP1P18509 176 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 G0S2P27469 103 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB5BP61020 215 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 ERASQ7Z444 233 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.43□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 PRLHP81277 87 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.42□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 CST9LQ9H4G1 147 aa5.41□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM238C9JI98 176 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5LO75964 103 aa5.4□□□□□ -1.54
SMARCE1-210ENST00000481231 VPREB1P12018 145 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 PFN2P35080 140 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 LCE2CQ5TA81 110 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM126AQ9H061 195 aa5.39□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01546A6NGU7 62 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R378 163 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 CTAG1AP78358 180 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 PMVKQ15126 192 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.38□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BRM9 83 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8NDZ9 215 aa5.37□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01549A6NIU2 74 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 MT1HP80294 61 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 ERG28Q9UKR5 140 aa5.36□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLC3P0DOY3 106 aa5.35□□□□□ -1.55
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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