RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467325.2

RALGPS1-210, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 5

Gene RALGPS1, Length 330 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-210ENST00000467325 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.22□□□□□ -1.57
RALGPS1-210ENST00000467325 C10orf25Q5T742 122 aa5.22□□□□□ -1.57
RALGPS1-210ENST00000467325 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.22□□□□□ -1.57
RALGPS1-210ENST00000467325 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.22□□□□□ -1.57
RALGPS1-210ENST00000467325 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.22□□□□□ -1.57
RALGPS1-210ENST00000467325 A0A0U1RRA0 63 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SLPIP03973 132 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 CXCL5P42830 114 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 HERV-K104P63124 156 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 C2orf48Q96LS8 159 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 LYSTQ99698 3801 aa5.21□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 A0A087WTM6 91 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 RTL8CO15255 209 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SMIM13P0DJ93 91 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SYCNQ0VAF6 134 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SFTA2Q6UW10 78 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 Q6ZRU5 148 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.2□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 F8WDY8 70 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 DDTP30046 118 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 PFN2P35080 140 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 LINC00158P58513 81 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 C14orf177Q52M58 125 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 LITAFQ99732 161 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 HIGD1BQ9P298 99 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 ERG28Q9UKR5 140 aa5.19□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 CTAG1AP78358 180 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 TNP2Q05952 138 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 Q8N814 137 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 DAND5Q8N907 189 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 CARD19Q96LW7 228 aa5.18□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 LINC00587B1AMM8 73 aa5.17□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 TMEM238C9JI98 176 aa5.17□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 TIMM17BO60830 172 aa5.17□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 HIST1H4GQ99525 98 aa5.17□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 EREGO14944 169 aa5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 NPC2P61916 151 aa5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 RNF151Q2KHN1 245 aa5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RALGPS1-210ENST00000467325 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 HSD52Q0P140 79 aa5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 COX17Q14061 63 aa5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 SPANXCQ9NY87 97 aa5.15□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 GCSHP23434 173 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 TAL2Q16559 108 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 LINC01620Q4KN68 170 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 GAGE2EQ4V326 116 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 CEND1Q8N111 149 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.14□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 KMT2AQ03164 3969 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 IFITM1P13164 125 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 GAGE2BQ13066 116 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 Q6ZRP5 223 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 Q6ZVH6 145 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 DNAH2Q9P225 4427 aa5.13□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 PTTG1IPP53801 180 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 FXYD2P54710 66 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 KRTAP10-2P60368 255 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 BATFQ16520 125 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.12□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 A4D1N5 150 aa5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 M0R143 59 aa5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 COPS9Q8WXC6 57 aa5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.11□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 A0A096LNI7 61 aa5.1□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.1□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.1□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RALGPS1-210ENST00000467325 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms