RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CARD19Q96LW7 228 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00587B1AMM8 73 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF151Q2KHN1 245 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf82Q6UX34 121 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRU5 148 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 RYR2Q92736 4967 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SLPIP03973 132 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA45Q537H7 98 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF815PA8K554 130 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf25Q5T742 122 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH2Q9P225 4427 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 COX17Q14061 63 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.09□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 COX8AP10176 69 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-2P60368 255 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PCP2Q8IVA1 136 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 ERG28Q9UKR5 140 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0J9YXY3 114 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GVY2 172 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 DLEU1O43261 78 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GCSHP23434 173 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00158P58513 81 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TIMM17BO60830 172 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PFN2P35080 140 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf144Q96I85 54 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C12orf57Q99622 126 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM13P0DJ93 91 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 23.7
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0U1RRA0 63 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf90A8MZG2 172 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM238C9JI98 176 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2BQ13066 116 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01620Q4KN68 170 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZRP5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 PTTG1IPP53801 180 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2EQ4V326 116 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZVH6 145 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 COPS9Q8WXC6 57 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-208ENST00000462602 RYR3Q15413 4870 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LITAFQ99732 161 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 HIGD1BQ9P298 99 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A096LNI7 61 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TSTD3H0UI37 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 IFITM1P13164 125 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DPH3Q96FX2 82 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPANXCQ9NY87 97 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-1P60331 282 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 DAND5Q8N907 189 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO1933Q9H354 126 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 XAGE1AQ9HD64 81 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H4GQ99525 98 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-208ENST00000462602 CHTF8P0CG12 524 aa5.98□□□□□ -1.45
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