RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		6.12	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335		A0A096LNJ9	63 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335		F8VRH5	84 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	IGLC3	P0DOY3	106 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		6.11	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	C10orf25	Q5T742	122 aa		6.1	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	PANO1	I0J062	215 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	ATP6V1G1	O75348	118 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	KIAA0087	Q14695	138 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		6.09	□□□□□ -1.43
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BK	O60814	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BO	P23527	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BB	P33778	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BD	P58876	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BC	P62807	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	SFTA2	Q6UW10	78 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		6.08	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	C11orf86	A6NJI1	115 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	PLN	P26678	52 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HERVK_113	P61574	105 aa		6.07	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	DPM2	O94777	84 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335		Q6ZRP5	223 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	NUPR1	O60356	82 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	PFN2	P35080	140 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	UBE2B	P63146	152 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HSPG2	P98160	4391 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	RYR1	P21817	5038 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	LINC00587	B1AMM8	73 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	IGKC	P01834	107 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	S100A6	P06703	90 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	LINC00158	P58513	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335		A0A1W2PNN7	141 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM223	A0PJW6	202 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	C20orf202	A1L168	122 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	S100A2	P29034	98 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	ODF1	Q14990	250 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335	HERC2	O95714	4834 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PKP4-208	ENST00000462335		J3QL48	77 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335		M0QXV9	152 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	LINC00310	P59036	64 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	KRTDAP	P60985	99 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	COX17	Q14061	63 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	FAM168B	A1KXE4	195 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	HERV-K104	P63124	156 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	PET117	Q6UWS5	81 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335		A0A0U1RRA0	63 aa		6	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	LEPROT	O15243	131 aa		6	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	AKR1D1	P51857	326 aa		6	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	C1orf137	Q5JT78	98 aa		6	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		6	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335		J3QQQ9	107 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.98	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	NMU	P48645	174 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.97	□□□□□ -1.45
PKP4-208	ENST00000462335	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.97	□□□□□ -1.45

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