RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 ADCYAP1P18509 176 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 PEA15Q15121 130 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC13O75165 2243 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 H0YGG7 62 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TSKUQ8WUA8 353 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TSLPQ969D9 159 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 S100A13Q99584 98 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0G2JQZ4 141 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 PIPP12273 146 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 INSL4Q14641 139 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 AQP10Q96PS8 301 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM262E9PQX1 116 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 IQCJQ1A5X6 159 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087WXM4 84 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 SNCAP37840 140 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00315P59091 139 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf82Q6UX34 121 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 DPY30Q9C005 99 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 BET1LQ9NYM9 111 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 ROS1P08922 2347 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TFF1P04155 84 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N8P6 123 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 VAMP8Q9BV40 100 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 PROK2Q9HC23 129 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PNN7 141 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 CCL22O00626 93 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 MT-ATP8P03928 68 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 MED12Q93074 2177 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 RBAKDNA6NC62 111 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PIN1P1O15428 100 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV6-57P01721 117 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 GNG11P61952 73 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2G1P62253 170 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE6HQ13956 83 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TPRXLQ17RH7 258 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 C12orf73Q69YU5 71 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ATG5Q9H1Y0 275 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DPH3P1Q9H4G8 78 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC4Q99102 2169 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP10-10P60014 251 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOBQ15370 118 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ALKAL2Q6UX46 152 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM141Q96I45 108 aa2.51□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 CADP27708 2225 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKCP01834 107 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM106BQ9NUM4 274 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP5-8O75690 187 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 NMBP08949 121 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00032P0C843 101 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLC1P0CG04 106 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A6P12236 298 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf137Q5JT78 98 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00312Q9Y6C7 94 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 A6NIN4 97 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 COX7CP15954 63 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 EFNA4P52798 201 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 Q1T7F1 81 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR9Q5T870 116 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 C5orf38Q86SI9 138 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TENM2Q9NT68 2774 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 F8W1H4 67 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BQ15 152 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 HMGN3Q15651 99 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC48A1Q6P1K1 146 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.7 ms