RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439407.1

LMCD1-AS1-202, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 576 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 USP17L23D6RBM5 183 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 F8WDY8 70 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LECT2O14960 151 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NPC2P61916 151 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CEND1Q8N111 149 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COPS9Q8WXC6 57 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C2orf48Q96LS8 159 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ERG28Q9UKR5 140 aa4.47□□□□□ -1.69
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A6NDN8 102 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IFITM1P13164 125 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SYCNQ0VAF6 134 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C14orf177Q52M58 125 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q6ZVH6 145 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DAND5Q8N907 189 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C15orf56Q8N910 161 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.46□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A6NJY4 79 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COX17Q14061 63 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C10orf25Q5T742 122 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SPANXCQ9NY87 97 aa4.45□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 FXYD2P54710 66 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q6ZRU5 148 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RAB37Q96AX2 223 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LITAFQ99732 161 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.44□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A4D1N5 150 aa4.43□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EREGO14944 169 aa4.43□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q6ZR54 194 aa4.43□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CARD19Q96LW7 228 aa4.43□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RNF151Q2KHN1 245 aa4.42□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GAGE2EQ4V326 116 aa4.42□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.42□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 GAGE2BQ13066 116 aa4.41□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 WFDC2Q14508 124 aa4.41□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.41□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.41□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.41□□□□□ -1.7
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SLPIP03973 132 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CFC1BP0CG36 223 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CFC1P0CG37 223 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q1RN00 199 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.4□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A087WTM6 91 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 H7C2G1 150 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 K7ERJ3 54 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DPH3Q96FX2 82 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.39□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A0B4J2C4 111 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LCE6AA0A183 80 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 C9orf118A6NHY6 69 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TAX1BP3O14907 124 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PSMB2P49721 201 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q8N814 137 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.38□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 DNHD1Q96M86 4753 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 A0A1B0GWB2 263 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 H3BUT2 72 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NDUFC2O95298 119 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 Q6ZRP5 223 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.37□□□□□ -1.71
LMCD1-AS1-202ENST00000439407 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms