RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436759.6

PLEC-208, Transcript of plectin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEC, Length 14,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-208ENST00000436759 C8orf87E5RJ46 101 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 SPINK1P00995 79 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 ACYP2P14621 99 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 C4orf26Q17RF5 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 CDIP1Q9H305 208 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 Q9BRP9 147 aa8.72□□□□□ -1.01
PLEC-208ENST00000436759 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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PLEC-208ENST00000436759 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.71□□□□□ -1.01
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PLEC-208ENST00000436759 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.7□□□□□ -1.02
PLEC-208ENST00000436759 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.7□□□□□ -1.02
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PLEC-208ENST00000436759 IGKV2-30P06310 120 aa8.54□□□□□ -1.04
PLEC-208ENST00000436759 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.53□□□□□ -1.04
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PLEC-208ENST00000436759 NUPR2A6NF83 97 aa8.53□□□□□ -1.04
PLEC-208ENST00000436759 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.53□□□□□ -1.04
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PLEC-208ENST00000436759 Q8NA96 180 aa8.51□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 A8MTW9 85 aa8.5□□□□□ -1.05
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PLEC-208ENST00000436759 LY6G6CO95867 125 aa8.49□□□□□ -1.05
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PLEC-208ENST00000436759 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.48□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.47□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 LINC01006Q8NI28 216 aa8.47□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.47□□□□□ -1.05
PLEC-208ENST00000436759 PRO0461Q9UI25 63 aa8.47□□□□□ -1.05
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