RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 C7orf71A4D174 169 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 CRYGAP11844 174 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A4P12235 298 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 ASIPP42127 132 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 TDRG1Q3Y452 100 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 HSPB11Q9Y547 144 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRK-212ENST00000434424 MYCBP2O75592 4640 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 GABARAPH6UMI1 98 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 PMP2P02689 132 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TRGC2P03986 189 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SPCS2Q15005 226 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 Q8N814 137 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CCDC160A6NGH7 325 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 H7BYZ3 331 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 M0R2Z0 102 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 AKAIN1P0CW23 69 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 A0A096LPF7 62 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CD3DP04234 171 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 IGLC1P0CG04 106 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 DEFB1P60022 68 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF345Q14585 488 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK9Q5DT21 86 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 Q6ZQT0 140 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM126AQ9H061 195 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 COPZ2Q9P299 210 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 Q6ZSA8 131 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TP53RKQ96S44 253 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 PRO0255Q9UI72 69 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 H3BRN7 92 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TPRXLQ17RH7 258 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 NAA60Q9H7X0 242 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 V9GYH0 126 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRK-212ENST00000434424 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 A8MTW9 85 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 RAB4BP61018 213 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SCGB1A1P11684 91 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP10-10P60014 251 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SMCO1Q147U7 214 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 U3KQ87 197 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 NMSQ5H8A3 153 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 CARD19Q96LW7 228 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 CST9LQ9H4G1 147 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFB6O95139 128 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 CXCL1P09341 107 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 BCL2P10415 239 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A6P12236 298 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 IL7P13232 177 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms