RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB4AO15263 64 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 LELP1Q5T871 98 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 COX7B2Q8TF08 81 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 CELA1Q9UNI1 258 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 K7ERU9 68 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 LY6G6CO95867 125 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-33P01772 117 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1A-204ENST00000424089 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.9□□□□□ -1.3
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POLR1A-204ENST00000424089 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 RETNQ9HD89 108 aa6.89□□□□□ -1.31
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POLR1A-204ENST00000424089 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 H3BMG7 143 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 COX6CP09669 75 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 PSMB2P49721 201 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 Q8IZM0 81 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 HTN3P15516 51 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 CXCL5P42830 114 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 Q1RN00 199 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.87□□□□□ -1.31
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POLR1A-204ENST00000424089 M0QXV9 152 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 COX7A2LO14548 114 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 REG3AQ06141 175 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf38Q86SI9 138 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 PRO0461Q9UI25 63 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 NUPR2A6NF83 97 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 J3QR89 54 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLR1A-204ENST00000424089 ATXN8Q156A1 80 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 PRR34Q9NV39 138 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 TCL1BO95988 128 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 COX17Q14061 63 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-204ENST00000424089 MALP21145 153 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00158P58513 81 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 WFDC2Q14508 124 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP161Q6P656 301 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 DAND5Q8N907 189 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.83□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.83□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 CKS1BP61024 79 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 NPC2P61916 151 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.82□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 H7C2G1 150 aa6.81□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 FOXI1Q12951 378 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZTC4 211 aa6.81□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.79□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.79□□□□□ -1.32
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POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A20O43772 301 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 CCL18P55774 89 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 ENHOQ6UWT2 76 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 TEN1Q86WV5 123 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-204ENST00000424089 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.77□□□□□ -1.33
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POLR1A-204ENST00000424089 F8WDY8 70 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 H3BT86 120 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 LST1O00453 97 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFC2O95298 119 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 PFN2P35080 140 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.77□□□□□ -1.33
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