RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECHDC3-201ENST00000379215 CARD19Q96LW7 228 aa16.12■□□□□ 0.17
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ECHDC3-201ENST00000379215 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.1■□□□□ 0.17
ECHDC3-201ENST00000379215 LECT2O14960 151 aa16.1■□□□□ 0.17
ECHDC3-201ENST00000379215 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.09■□□□□ 0.17
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ECHDC3-201ENST00000379215 CNBPP62633 177 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ECHDC3-201ENST00000379215 WFDC2Q14508 124 aa16.05■□□□□ 0.16
ECHDC3-201ENST00000379215 ARL17AQ8IVW1 177 aa16.05■□□□□ 0.16
ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa16.05■□□□□ 0.16
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ECHDC3-201ENST00000379215 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.02■□□□□ 0.16
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAH6Q9C0G6 4158 aa16.02■□□□□ 0.15
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ECHDC3-201ENST00000379215 RAB37Q96AX2 223 aa16.01■□□□□ 0.15
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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ECHDC3-201ENST00000379215 PKIGQ9Y2B9 76 aa16■□□□□ 0.15
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ECHDC3-201ENST00000379215 K7ERJ3 54 aa15.97■□□□□ 0.15
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ECHDC3-201ENST00000379215 NDUFC2O95298 119 aa15.97■□□□□ 0.15
ECHDC3-201ENST00000379215 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.96■□□□□ 0.15
ECHDC3-201ENST00000379215 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3-201ENST00000379215 LCE6AA0A183 80 aa15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3-201ENST00000379215 TAX1BP3O14907 124 aa15.94■□□□□ 0.14
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAH10Q8IVF4 4471 aa15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3-201ENST00000379215 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ECHDC3-201ENST00000379215 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
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ECHDC3-201ENST00000379215 KMT2AQ03164 3969 aa15.92■□□□□ 0.14
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