RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 COL4A6Q14031 1691 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAT3Q8TDW7 4589 aa-1.21□□□□□ -2.6
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RNU6-407P-201ENST00000365280 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GWA3 101 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 I3L3M4 83 aa-1.22□□□□□ -2.6
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RNU6-407P-201ENST00000365280 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.23□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 LCN9Q8WX39 176 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCN7AQ01118 1682 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM25GB3EWG6 89 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2D3P61077 147 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 UBE2D2P62837 147 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 MBD5Q9P267 1494 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.25□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLIT1O75093 1534 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 GNG11P61952 73 aa-1.27□□□□□ -2.61
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RNU6-407P-201ENST00000365280 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
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RNU6-407P-201ENST00000365280 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 HTTP42858 3142 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 C12orf57Q99622 126 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAP1L6A6NFF2 107 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 AKAIN1P0CW23 69 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf54Q8WWF1 131 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 AKAP13Q12802 2813 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CUBNO60494 3623 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLIP1P30622 1438 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFA2O43678 99 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNCAP37840 140 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 TOP2BQ02880 1626 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 LYSTQ99698 3801 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 AKAP9Q99996 3911 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACACAQ13085 2346 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0G2JND7 137 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 H3BQ15 152 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 H3BQF6 201 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 K7EP13 123 aa-1.32□□□□□ -2.62
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