RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q8IZM0 81 aa13.6□□□□□ -0.23
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SFTA2Q6UW10 78 aa13.59□□□□□ -0.23
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FXYD2P54710 66 aa13.58□□□□□ -0.24
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXCL5P42830 114 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM13P0DJ93 91 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFITM1P13164 125 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf82Q6UX34 121 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf223Q8N319 242 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAX1BP3O14907 124 aa13.47□□□□□ -0.25
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GWB2 263 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DAND5Q8N907 189 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERG28Q9UKR5 140 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C15orf56Q8N910 161 aa13.46□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COPS9Q8WXC6 57 aa13.46□□□□□ -0.26
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTL8CO15255 209 aa13.43□□□□□ -0.26
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PFN2P35080 140 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COX17Q14061 63 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAB37Q96AX2 223 aa13.41□□□□□ -0.26
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C2orf48Q96LS8 159 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSCAO43653 123 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFC1BP0CG36 223 aa13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFC1P0CG37 223 aa13.4□□□□□ -0.26
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0B4J2C4 111 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf118A6NHY6 69 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LECT2O14960 151 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.37□□□□□ -0.27
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNP2Q05952 138 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BUT2 72 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZRU5 148 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.31□□□□□ -0.28
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
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