RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 PRO0461Q9UI25 63 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0J9YWU9 116 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GVY2 172 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM262E9PQX1 116 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA1O15239 70 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 HERV-K104P63124 156 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZSN1 163 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZUT4 128 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TEN1Q86WV5 123 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM243Q9BU79 118 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TCL1BO95988 128 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK8P0C7L1 97 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXI1Q12951 378 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE12JA6NER3 117 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C2G1 150 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A20O43772 301 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE4Q13068 117 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE5Q13069 117 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 SFTA2Q6UW10 78 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZTI0 123 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM104AQ969W3 186 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.94□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 C9JAW5 83 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 PRM2P04554 102 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01620Q4KN68 170 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 MTURNQ8N3F0 131 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LITAFQ99732 161 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BT86 120 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE7O76087 117 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE12FP0CL80 117 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE12GP0CL81 117 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 GAGE12IP0CL82 117 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01600Q96MT4 127 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9H8V8 135 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.91□□□□□ -1.62
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GV72 72 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIAP1O43715 76 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB135Q30KP9 77 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf82Q6UX34 121 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7B2Q8TF08 81 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2WQ96B02 151 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9UF83 564 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LYRM9A8MSI8 78 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LST1O00453 97 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 RTL8CO15255 209 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 COX6A2Q02221 97 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 FHL2Q14192 279 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 CARD19Q96LW7 228 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 F5H768 121 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R2N4 97 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.6 ms